报告题目:蛋白质动力学的多尺度理论与计算模拟
报告人: 李文飞教授(南京大学)
时 间:5月17日(星期二),15:30-16:30
地 点:腾讯会议室
报告摘要:
复杂生命过程在分子层次上主要表现为蛋白等生物分子机器的组装与功能运动。近年来,随着结构生物学技术以及基于深度学习的结构预测算法的发展,人们已经积累了丰富的关于蛋白质等生物分子机器的结构信息。然而,这些生物分子机器如何组装、运转,从而实现转录调控、物质输运、催化等生物学功能仍很不清楚,也是目前生物物理领域人们关注的核心问题。回答这些问题依赖于对其动力学过程的精确表征。报告人将结合相关具体工作,介绍多尺度计算模拟方法在蛋白质组装与功能动力学研究中的应用,包括单分子酶催化动力学、金属离子调控的蛋白质组装与别构动力学、以及细胞粘附的力学调控机制等,尝试从物理的角度理解自然界生物分子机器为实现高效而精巧的生物学功能所采取的策略。
报告人简介:
李文飞,南京大学物理学院教授、博士生导师。1999年本科毕业于内蒙古民族大学;1999-2004年在中科院近代物理研究所读博士学位,专业为粒子物理与原子核物理;2004-2006年在南京大学物理学院做博士后,开展理论与计算生物物理研究;2006年开始在南京大学物理学院工作;期间于2008-2010年在日本京都大学做博士后;2017-2018年在美国国立卫生研究院(NIH)做访问学者。主要研究兴趣包括蛋白质等生物大分子的折叠组装与功能动力学、酶催化物理机制、以及多尺度理论与计算方法等。